西历2059年，计划寻找新天地的银河移民船团“macross frontier”上，一名以看到车子在这里停下，这栋楼天台上的人沸腾了，当看见车门打开，驾驶室里跳下来的是陈源的时候，天台上有望远镜的人马上把陈源的身份在天台上宣扬开了，陈源来过天台近十次，这今天台上的人可都不陌生了。驾驶员为目标而努力的少年早乙女阿尔特感受到了前所未有的闭塞感。这个时候，位于银河顶端的歌姬雪莉露·诺姆来到船团举行巡回演唱会，阿尔特以及憧憬着雪莉露的少女兰花·李当天都来到了会场。 然而演唱会当中，却突然遭到重机架生命体的袭击。为了保护少女们，阿尔特登上了最新型可变战斗机VF-25。在战火烽烟的尽头，传说中可以震撼宇宙的“歌”以及纠缠着少女们的“迷”究竟是什么……？
